近日，市环科院水所张赛伟博士以第一作者、同济大学王磊教授为通讯作者在Cell旗下《STAR Protocols》期刊上发表题为“Protocol to analyze the inhibitory effect of free organic carbon generated by chemoautotrophic bacteria on their CO2 fixation”的论文，系统介绍分析化能自养细菌自身产生的胞外游离有机物抑制细菌固碳的实验方案。

全球CO2浓度升高导致了一系列严峻的环境问题，化学自养细菌在缓解全球CO2浓度升高过程中发挥着不容忽视的作用。然而，最近发现化学自养细菌自身产生的胞外游离有机碳（EFOC）可能负反馈抑制细菌固定CO2。因此，明确EFOC对化能自养细菌的抑制作用及其主要抑制因素和抑制机制可为抑制成分靶向去除技术的发展提供理论指导，进而为促进化能自养细菌的高效固碳奠定基础。该实验方案以硫氧化细菌硫酸杆菌（Thiobacillus thioparus）作为模型生物，构建了去除EFOC的膜生物反应器，评估了膜生物反应器和传统反应器中的细菌固碳效率，并开展了验证EFOC抑制化能自养细菌固定CO2的模拟实验，结合HPLC、qPCR等分析手段，进行了组分分析和相关性分析，开展了主要抑制成分对细菌固碳和基因转录水平的模拟实验，分析了EFOC中主要抑制成分和核酮糖二磷酸羧化酶/加氧酶（RuBisCO）基因丰度和转录水平，以阐明EFOC主要抑制组分对化能自养细菌固碳的作用及其抑制机制。